在自家院子里面蓋房子是否需要重新辦理土地使用證

我想問一下，我家在1994年，在自家的院子里面蓋了一所房子，當(dāng)初的時候沒有辦理土地使用證和房產(chǎn)證，村里和鄉(xiāng)里也沒有人過問此事，現(xiàn)在趕上新農(nóng)村建設(shè)，說要撤村建鎮(zhèn)，在做房產(chǎn)評估的時候，評估的人員把這所房子不算面積，請問一下如果現(xiàn)在想辦理土地使用整合房產(chǎn)證還行嗎？同時，想問一下，我們家的耕地在03年的時候讓村委會給賣了，但是沒有我們簽字，我父親去找村支書，他說他給簽的字，而且不給我父親看簽字，還讓我父親去法院告！